大侦探明智小五郎将要踏上侦探之路，他夜里站在大桥上看到一个可疑的男子，因为丢失了一件衣服和一根手指，紧接着先是将东西扔进河里，后又是将几万元金钱烧尽，随后在夜黑风高的五重塔上上吊自杀，这一切的源头究竟是什么？中学时代的几位密友，因为好奇心，追求神秘的秘密结社。不想，一场意外的死亡竟为他们未来的生活埋下了怨恨的种子。长大成人的过程中，社团成员中有人飞黄腾达，有人自缢于五重塔。他们是在用自己的方式解脱藏在各自心中的诅咒吗？究竟什么才是真相？

稻垣美术商店招聘女营业员，应聘者先后行踪不明。商店又招聘男推销员，但工作只是将石膏模型无偿送给各个美术学校。接下来的几天里，陆续发生了碎尸案美人鱼案，民间犯罪学者畔柳博士接手此案，却迟迟没有进展。直到出国游历的大侦探明智回到日本，案件的真相才渐渐浮出水面。

深夜的浅草公园、打烊后的商场里，侏儒的身影总是鬼魅般地出现，然后凭空消失得无影无踪。伴随着他出现的，还有骇人的断肢残骸。这是谁的断肢，凶手又是什么人？山野家的小姐山野三千子离奇失踪，她会不会已经遇害了？养源寺的和尚到底扮演了什么角色？经典的密道诡计、神秘的人偶师傅、热心的业余侦探……终，还是要靠大侦探明智一锤定音。

布引庄兵卫接到了一周前已经死去的女儿的电话，要他送赎金给罪犯接她回家。女儿生前的恋人鸟井纯一郎拿着女儿与某个男人的结婚照登门兴师问罪，这一切让布引庄兵卫无所适从。送赎金的时候，他发现了女儿与鸟井纯一郎的尸体，尸体上竟然还刻着字……

年轻有为的商社社长伊势省吾和美丽的女秘书冲晴美沉浸在甜蜜的爱情中，美术商真下幸彦和女友相马芳江筹划憧憬着婚后的美好生活，两对原本应该幸福美满的年轻人却因为一次意外在命运的十字路口纠缠在了一起。贪财的侦探、留守的村民、千载难逢的良机……看明智如何抽丝剥茧，拨开重重迷雾。

大河原义明是推理小说发烧友，他邀请有同样兴趣的武彦庄司担任秘书。一天，武彦庄司发现与大河原义明关系密切的姬田吾郎和村越均之间不和。不久，姬田吾郎在大河原义明的度假别墅附近遭杀害，几天后村越均与画家赞岐大吉也相继被残忍杀害，三具尸体身上都有凶手放置的鹅毛信。就在案件侦破陷入瓶颈之际，一本日记的出现打破了僵局。

明智小五郎与好友松村武的共同兴趣是侦探推理。某工厂巨款被盗，罪犯到案后一口咬定已挥霍一空。厂长发出巨额悬赏，找回赃款者可获得重奖。松村武兴趣十足，偶然发现一枚硬币的夹层里有暗号文书，破译后找到了赃款。但他贪念已起，不准备将赃款归还施主，明智小五郎只得说明原委。

路屋清一郎杀害了同学斋藤勇的房东老太太，将死者生前藏在花盆下的钱拿走一半交给了警方，想等风声过后再取出留在花盆下的另一半。没想到，斋藤勇一时贪心，拿走了另一半，报警时被搜出了赃款，因而成为重要嫌疑人。笠森检察官明知路屋清一郎有重大嫌疑，但路屋却顺利通过了他擅长的心理测试。眼看斋藤勇就要因为别人的罪行遭到处罚，明智却在看似不经意间就揭开了案件的真相。

诡异的影子、令人毛骨悚然的笑声，一直纠缠着世本芳枝夫妇。随后世本静夫遇害，大江光一被打昏，倒地的瞬间，只看到凶手一身绿衣。嫌犯被锁定为畸恋着世本芳枝且偏执地钟爱绿色的堂兄夏目太郎。随后，夏目太郎的父亲遇害，而世本静夫的尸体出现在了银行的保险柜里……

黑天使女盗贼黑蜥蜴企图诱拐岩濑庄兵卫的掌上明珠早苗，还想将岩濑的宝物埃及之星据为己有。屡屡收到恐吓信的岩濑恳求明智小五郎保护自己的女儿和宝石，可大侦探却一再失利。早苗被绑架，埃及之星落入敌手，连他自己也差点被淹死在大海中……